Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms