Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DMPKQ09013 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms