Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLFN5Q08AF3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms