Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FMODQ06828 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms