Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG1Q06432 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms