Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GRIN1Q05586 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms