Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPN12Q05209 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 345.3 ms