Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms