Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
OC90Q02509 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms