Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BEX3Q00994 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BEX3Q00994 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms