Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IRF9Q00978 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms