Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLTCQ00610 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLTCQ00610 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms