Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IRX1P78414 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms