Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
LOXL3P58215 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms