Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAGEA4P43358 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms