Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSOP43234 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms