Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ETFBP38117 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ETFBP38117 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ETFBP38117 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ETFBP38117 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms