Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FDFT1P37268 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms