Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTNNA1P35221 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms