Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GPC1P35052 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GPC1P35052 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GPC1P35052 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GPC1P35052 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GPC1P35052 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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