Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms