Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDI1P31150 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDI1P31150 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDI1P31150 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDI1P31150 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDI1P31150 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDI1P31150 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDI1P31150 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDI1P31150 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms