Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH4A1P30038 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms