Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD10P28358 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms