Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA3P25788 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms