Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRHP20396 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRHP20396 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRHP20396 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRHP20396 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms