Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms