Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms