Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TMEM225BP0DP42 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms