Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC192P0DO97 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.1 ms