Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 OR10J1-201ENST00000423932 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL450344.3-201ENST00000430770 378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ASH2LP2-201ENST00000453999 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SLC10A7-205ENST00000507030 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 LINC01099-203ENST00000514736 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 TRAV17-201ENST00000390445 484 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ST7-AS1_2.1-201ENST00000615247 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATXN8OSP0DMR3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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