Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1AO95602 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1AO95602 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms