Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIN3BO75182 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms