Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPFIA3O75145 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms