Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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HOXA3O43365 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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