Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.9 ms