Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMX2-CTNND1H3BSU7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms