Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms