Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XIRP2A4UGR9 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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