Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MTMR11A4FU01 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MTMR11A4FU01 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms