Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMG5Q9UPR3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMG5Q9UPR3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms