Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNRF3Q9ULT6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms