Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms