Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSKSQ9UJT2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSKSQ9UJT2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms