Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CNTNAP2Q9UHC6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CNTNAP2Q9UHC6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms