Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms