Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms