Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RRBP1Q9P2E9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms