Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MBD5Q9P267 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD5Q9P267 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD5Q9P267 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD5Q9P267 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD5Q9P267 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MBD5Q9P267 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms