Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HCN3Q9P1Z3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HCN3Q9P1Z3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HCN3Q9P1Z3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HCN3Q9P1Z3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HCN3Q9P1Z3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HCN3Q9P1Z3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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